JR支社
新潟県内にあるJRの駅は、ほとんどがJR東日本新潟支社の管内です。新潟支社は、新潟県内だけではなく、山形県の一部も管轄内です。具体的には、羽越本線は鼠ケ関駅～酒田駅、米坂線は小国駅～萩生駅までが新潟支社です。そして、磐越西線の県境付近にある福島県の徳沢駅も新潟支社管内です。上越新幹線のガーラ湯沢駅も、新潟支社管内となっています。
飯山線は、JR東日本長野支社の管轄です。新潟県内では、足滝駅～内ケ巻駅が長野支社のエリアです。
また、糸魚川地域の北陸本線・大糸線はJR西日本の管轄です。新潟県内のJR西日本の駅は、金沢支社の管内となっています。
